《代号：Dark》采用了卡牌玩法，并将其与各种内容混合在一起，使其足够硬核。虽然玩家很清楚游戏的整体流程，但随机性、类别、符文和其他细节极大地丰富了游戏玩法，使其既易于理解，又具有战略深度。这就是采取这种创造性玩法来赢得游戏差异化优势的方式。在玩法层面上，游戏遵循塔防游戏的核心设置。战斗系统预测敌人的移动，玩家需要沿着敌人的路径部署储物柜来阻止和摧毁他们。在角色战斗方面，游戏放弃了传统塔防游戏的回合制玩法，而采用类似植物大战僵尸的波浪攻击方式，玩家放置储物柜后就可以扮演管家的角色。有些关卡地图具有特殊的转向、减速和传送等功能。如果你犯了一个错误，或者不得不处理一个新的敌人路线，你就不能在开始游戏后进行切换，你唯一能做的就是控制角色的大动作的释放。因此，在放置角色之前，必须彻底了解储物柜和即将到来的敌人，并调整布局，否则角色将一事无成。

职业比赛的多样性让游戏更具深度。游戏目前分为六种职业，不同的职业都有自己的优势，不同的职业限制都有自己固定的位置和攻击范围，这样游戏就有了战略上的保障。玩家需要根据角色不同的职业特点合理安排自己的位置，同时及时释放角色的技能也是取胜的关键。因为添加了这些玩法，许多玩家批评它是《明日方舟》的克隆版，但事实上《代号：Dark》添加了许多创新元素。塔防只是游戏玩法的核心元素之一。除此之外，在某些关卡中，玩家可以控制角色探索封闭的地图，触发事件推动故事向前发展。

审讯也是游戏的亮点之一，玩家需要审问被拘留者，了解他们的想法和未知的过去。这里面的储物柜设计得很好从个性和出身到与其他被拘留者的关系，一切都包括在内。这些以囚犯的自由为依托的情节，也使他们的形象设计生动丰满。除了推送地图模式，还有多种玩法供玩家选择。包括roguelike游戏《无尽的噩梦》、BOSS挑战版《Inner Sea action》等玩法。这是玩家为角色获取升级材料的地方。

《代号：Dark》的各种纸牌和更丰富的建筑系统能够满足大多数玩家的战略需求。另一方面，塑造角色的玩法也增加了游戏的深度和长期可玩性。除了升级角色和技能，战斗力量还需要玩家扩大阵容。这要求玩家追逐更多角色。目前，游戏在角色战斗能力的平衡上有些许不足。普通R级角色值的开发存在一定的缺陷，使玩家无法根据自己的喜好选择角色。这将导致出现一些死牌，在一定程度上降低玩家收集纸牌的欲望。为了迎合学生玩家和上班族，游戏增加了一种生产模式，通过挂电话来创收，在一定程度上减轻了玩家的压力。同时在收入的过程中也加入了突发检查机制，各种随机事件层出不穷，使游戏的趣味性得到了进一步的丰富。